根据国务院专项整治行动方案提出的任务，北京市将专项整治行动分解落实为整治使用农产品源头污染、集中整治生产加工环节、整顿规范食品流通秩序、推动流通领域食品市场准入制度、严格餐饮消费监管、完善食品安全监控长效机制、强化药品质量安全监管等十个方面。

通过专项整治，北京市农业基地将100％实现标准化生产，杜绝生产、使用甲胺磷等5种高毒农药；食品加工企业100％持食品生产许可证生产，杜绝使用有毒有害物质加工食品行为；农产品批发市场100％纳入质量安全监测范围；杜绝餐饮经营单位无证照经营问题；取缔以名人代言药品广告；生猪100％实现定点屠宰；儿童玩具等10类产品生产企业100％建立质量档案；非法进口的食物100％退货或销毁。